docker stop、今まで正常にstopしてるもんだと思ってたけど違うらしい（docker stopは、デフォルトでは10秒経過するとプロセスにkillシグナルを送る）

という事で追加してみました（※docker 1.13以降、docker-compose.ymlはv2.2以降のフォーマットで利用可能です）

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// dockerは --init オプションをつける
$ docker run --init

docker-composeはこんな感じにinit:trueをつけます

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// --initなし（PID=1は/bin/bashになっている）
docker exec -it -u root -w /apps base-container bash
root@base-container:/apps# ps ax
  PID TTY      STAT   TIME COMMAND
    1 pts/0    Ss+    0:00 /bin/bash /bootstrap.sh
    7 pts/0    S+     0:00 tail -f /dev/null
    8 pts/1    Ss     0:00 bash
   13 pts/1    R+     0:00 ps ax

// --initあり（PID=1は/dev/initになっている）
docker exec -it -u root -w /apps base-container bash
root@base-container:/apps# ps ax
  PID TTY      STAT   TIME COMMAND
    1 pts/0    Ss     0:00 /dev/init -- /bootstrap.sh
    6 pts/0    S+     0:00 /bin/bash /bootstrap.sh
    8 pts/0    S+     0:00 tail -f /dev/null
    9 pts/1    Ss     0:00 bash
   14 pts/1    R+     0:00 ps ax

参考リンク